浅谈MYB转录因子家族的那些事~

在先前的推文中有粉丝留言说想看有关MYB转录因子的介绍,于是小远就赶紧搜集了一些资料来和大家一起分享。在写这篇推文之前,小远还疑惑为啥MYB能被称为明星转录因子?这个疑惑在写文章的过程中很快就被解开了,因为MYB不仅功能强大,而且现有的研究成果也非常的多。MYB转录因子家族作为真核生物中的一类十分保守的转录因子家族,参与了多个发育过程,如根毛发育、花粉形成、种子萌发、花茎强度等方面;在植物遭受干旱、紫外线、冷胁迫、高温胁迫、盐胁迫等非生物胁迫时,MYB转录因子也参与其中并对其进行调节;此外,MYB转录因子还与某些经济作物的品质好坏密切(例如鲜花色泽、果实颜色等)相关。由于MYB的研究成果实在太多,在本次的推文中小远只能和大家分享其中的一小部分(MYB转录因子在非生物胁迫中的研究),希望大家通过阅读本文可以对MYB家族有一定的了解。

本次推文的主要内容(绿色部分)如下:

《浅谈MYB转录因子家族的那些事~》

1.背景介绍
1.1 MYB转录因子的发现

植物中第一个MYB转录因子是1987年从玉米中克隆到的ZmMYBC1,研究表明,ZmMYBC1主要参与玉米花青素的合成(Paz-Ares et al., 1987)。此后研究人员利用功能基因组学、转录组学和蛋白质组学等现代分子工具在各种植物中发现和筛选出了大量的MYB转录因子,同时,不断深入地研究也揭示了MYB转录因子在植物生长发育过程中各种途径的调控机制,越来越多的证据支持MYB是植物育种与改良的潜力转录因子。

1.2 MYB转录因子的结构及分类

MYB转录因子因其N端高度保守的MYB结构域而著称。该结构域一般由1~4段串联且不完全重复序列(R)组成。每个重复序列由50~53个保守的氨基酸残基及中间的间隔序列组成,并形成3个螺旋。第3个螺旋蛋白重复序列组成了一个螺旋-转角-螺旋(HTH)结构,该结构具有3个疏水残基,在HTH三维结构中形成疏水核心。每个重复序列的第3个螺旋是与DNA直接接触的识别螺旋,并插入DNA分子的大沟中。根据MYB基因包含的R结构的个数可以将MYB转录因子分为四类(图1)(郭凯等, 2020):

(1)1R(R1/2,R3-MYB)主要参与植物的形态发生、次生代谢、生物钟控制及花和果实的发育等生理过程。

(2)2R(R2R3-MYB)是植物MYB家族中数量最多的一类。根据蛋白质DNA结合区保守氨基酸的基序,2R类成员又可以分为28个亚类。这类MYB成员广泛参与植物初生及次生代谢、细胞分化、激素信号传导、生长发育调控、生物及非生物逆境响应等生命过程。

(3)3R(R1R2R3-MYB)存在于大多数真核生物基因组中,它们代表了相对保守的一个基因类别,在细胞周期控制方面起到重要的调控作用。

(4)4R(R1R2R2R1/2-MYB)是数量最少的一类MYB转录因子,其成员包含4个R1/R2重复。目前对植物中4R-MYB类蛋白质功能研究较少。

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图1 植物MYB转录因子分类(Dubos et al., 2010)。

2. MYB转录因子在非生物胁迫中的功能

2.1 干旱胁迫

干旱是影响植物生长和作物产量的重要环境胁迫之一,其严重影响植株生长发育,限制了农作物的产量和质量。在干旱条件下,土壤缺水,植物根部无法吸收足够的水分用于正常的生长发育;同时,叶片气孔关闭,外界二氧化碳不能进入植物体内用于碳同化,在造成光合作用降低的同时,植物的光呼吸增加。另外,干旱还严重影响光合作用和呼吸作用过程中正常的电子传递,造成电子泄露,产生大量活性氧。这些活性氧会影响植物细胞正常的生理代谢,造成植物体生长发育过程受阻,直至死亡(Chen et al., 2006)。在干旱胁迫下,MYB转录因子可以通过调控代谢产物黄酮类化合物、蜡质、角质等生物合成基因的表达,调控植物的抗旱性。此外,MYB转录因子还可以通过ABA信号参与气孔运动(图2)。

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图2 MYB转录因子在植物抗旱中的作用(Wang et al., 2021)。

2.1.1 MYB通过调控类黄酮和角质层合成来影响抗旱

黄酮类化合物是植物次生代谢的重要组成部分,可以作为抗氧化剂通过清除活性氧来保护植物免受生物和非生物胁迫。研究表明拟南芥的MYB转录因子(MYB12和MYB75/PAP1)是类黄酮生物合成的关键调控因子(图2)。在转基因植物中,MYB12的过表达显著增加了类黄酮的积累,使植物对干旱和氧化胁迫等非生物胁迫的耐受性增强(图3)(Wang et al., 2016)。

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图3 转基因拟南芥在干旱胁迫下的表型(Wang et al., 2016)。WT:野生型;KO:ATMYB12敲除突变体;#3/#6:ATMYB12过表达植株。

角质层是植物最重要的结构之一,它可以减少地上植物器官水分的散失。角质层的主要成分是角质和蜡,它们的生物合成受到MYB转录因子的广泛调控。研究表明,MYB41、MYB30、MYB94、MYB96、MYB16和MYB106等,可以通过调控角质和蜡的生物合成来影响植物对干旱胁迫的响应(图2)。在拟南芥中,MYB96的过表达可以促进表皮蜡质生物合成上调,从而提高拟南芥的耐旱性(图4)(Lee et al., 2014)。

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图4 通过电镜观察到MYB96过表达植株的叶片表皮蜡晶体增加(Lee et al., 2014)。

2.1.2 MYB通过ABA信号参与气孔运动

MYB转录因子还可以通过ABA信号参与调控气孔运动来影响植物的耐旱性(Hetherington, 2003)。拟南芥的MYB60是首个被发现参与气孔运动调控的转录因子(Cominelli et al., 2005)。在光照条件下,MYB60可以促进气孔打开,而在黑暗、干燥和ABA(脱落酸)处理下,MYB60则抑制气孔打开。在myb60突变体中光-诱导的气孔开放被抑制,植物水分流失减少,对干旱的耐受性增强。相反的,MYB60过表达植株则表现出对干旱胁迫的超敏反应(图5)(Oh et al., 2011)。MYB124和MYB88在气孔的形成中起着关键作用,它们限制了保卫母细胞的分裂,防止了气孔簇的形成。MYB44、MYB77、MYB15和MYB37通过ABA信号可以促进气孔关闭,提高植物对干旱的耐受性。而MYB20在ABA介导的气孔关闭中起负调控作用,使得植物对干旱表现出更大的敏感性(图2)。

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图5 MYB60过表达植株在干旱条件下的生长表型及叶片气孔开放程度(Oh et al., 2011)。

2.盐胁迫

土壤中盐分含量过多时,会降低土壤溶液的渗透势,造成植物吸水困难,不但种子不能萌发或延迟萌发,而且正在生长的植物也不能吸水或者吸水困难,形成生理干旱。另外,高浓度的钠离子可以置换细胞膜中的钙离子,降低生物膜的稳定性,细胞内的钾离子及其它有机溶质外渗,进而引起植物细胞内生理代谢紊乱。MYB转录因子的一些成员也有助于植物的耐盐性,它们可以通过调控角质层形成、抗氧化防御、ABA信号的基因、SOS2表达等来增强植物的耐盐性(图6)。

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图6 MYB转录因子通过调节下游靶基因参与盐胁迫(Wang et al., 2021)。

MYB49可以通过调节角质层形成和抗氧化防御来增加植物对盐胁迫的耐受性。MYB20通过直接与PP2Cs(ABA信号传导的主要负调节剂)启动子结合来负调节其表达,从而调控植物在盐胁迫条件下的耐受性。此外,MYB44也可以通过调节PP2Cs参与盐反应。盐诱导的PP2Cs基因如ABI1ABI2ATPP2CAHAB1HAB2MYB44过表达的植物中减少,但在myb44突变体中增强。MYB7通过负调控ABI5在种子发芽期间参与盐胁迫反应,MYB7的突变会导致种子在发芽期间盐胁迫敏感。MYB42则是通过调控SOS2的表达来增强植物的耐盐性(图7)(Sun et al., 2020)。另外一些MYB转录因子,如MYB41和MYB15,其过表达可以增强植物在发芽和根系生长方面的耐盐性。而MYB52则负向调控植物的耐盐性,其过表达会导致种子萌发对盐胁迫超敏。

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图7 MYB42通过调控SOS2的表达来增强植物的耐盐性(Sun et al., 2020)。

2.3 高温胁迫

温度是影响植物生长发育、产量和质量以及地理分布的关键环境因子。高温造成的热害可以直接影响作物的生长发育及各种代谢活动,尤其是生殖生长时期生殖器官(如花粉)的代谢和发育(图8)(Vu et al., 2019)。此外,高温还可以直接影响植物细胞内多种组分的稳定性以及多种生理生化反应的正常进行。研究表明,高温下光合作用和呼吸作用均受到抑制,随着温度的升高,光合速率的下降要先于呼吸速率,造成植物饥饿死亡。另外,高温还使植物体内活性氧代谢失调,产生大量的活性氧直接破坏细胞结构和生物大分子(El-Kereamy et al., 2012)。

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图8 高温可以影响种子萌发到开花结果各个阶段不同器官的生长发育(Vu et al., 2019)。

在植物响应高温胁迫的过程中,MYB类转录因子同样起到了非常重要的作用。OsMYB55能直接激活谷氨酸代谢相关基因,使过表达株系体内总氨基酸、谷氨酸、脯氨酸和精氨酸的含量提高,这些代谢产物大都能直接或间接提高植物对逆境的耐受性。MYB68在拟南芥对高温的响应过程中起着非常重要的作用,高温条件下,拟南芥根部MYB68的表达量显著增加,同时MYB68基因的突变体植株生长速率显著低于野生型。MYB30可以通过调节钙信号通路参与氧化和热应激反应,缺乏MYB30蛋白的植物在H2O2和热刺激下表现出[Ca2+]cyt的升高。高温还可以使CmMYB012直接与CmFNSCmCHSCmDFRCmANSCmUFGT的启动子结合并抑制其表达,导致黄酮类物质和花青素的减少,而黄酮和花青素的减少削弱了植物应对高温胁迫的能力(Zhou et al., 2021)。此外,Hao等人还发现McMYB4可以通过调节苯丙烷代谢和激素信号传导,协调苹果的生长和抗性,从而提高苹果的温度适应性(图9)(Hao et al., 2021)。

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图9 McMYB4在不同温度条件下调节苯丙烷代谢和激素信号通路的工作模型(Hao et al., 2021)。

2.4 低温胁迫

低温是植物生长过程中遇到的重要的非生物胁迫因子之一,它对植物的生长、发育、产量以及地理分布均有影响。在长期进化的过程中植物形成了复杂而高效的分子调控机制,从而抵御和适应低温胁迫。当植物受到低温胁迫后,低温信号首先由细胞膜感知,然后通过相应的低温信号传递途径将低温信号向下游传递,与相关转录因子(如,MYB等)结合,激活一系列转录调控过程,调控目的基因的表达,从而提高植物的耐冷与耐寒性。

在拟南芥中,MYB15受低温诱导上调表达,MYB15蛋白通过与ICE1互作后结合到关键的冷反应转录因子CBFs启动子元件上来调控植株抗冻性,MYB15过表达导致CBFs表达和植株抗冻性降低,而myb15突变体则表现出CBFs表达和植株抗冻性增加,这表明MYB15负调控CBF的表达。而MYB96受到冷胁迫的诱导后,会通过调节CBF的表达来激活植株的抗冻能力。OsMYB3R-2主要通过上调细胞周期蛋白(Cyclin)基因OsCycB1;1OsDREB1s的表达赋予植株耐冷性,而OsMYBS3则通过抑制OsDREB1B的表达负调控植株耐冷性。过表达OsMYB4基因可以大大提高水稻对低温,干旱和高盐等非生物胁迫的耐受能力。在白桦中过量表达BpMYB4基因同样能够提高白桦的耐低温能力。此外,在低温胁迫下,MdMYB88和MdMYB124可以作用于MdCCA1的上游,通过结合其启动子的AACCG基序直接调控其表达。激活MdCCA1后,可调节MdCBF基因的表达,诱导COR基因的表达并促进花青素的积累,后者有助于冷胁迫下H2O2的清除。MdMYB88和MdMYB124还可以直接调控MdCSP3的表达,MdCSP3则通过CBF独立的途径增强苹果的耐寒性(图10)(Xie et al., 2018)。

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图10 苹果MdMYB88和MdMYB124在冷胁迫条件下的工作模型(Xie et al., 2018)。

2.5 紫外线胁迫

Ultraviolet-B (UV-B)(中波紫外线)对植物来说是一种非生物胁迫,会影响植物的生长和适应。并且,它也可以调节植物光形态建成,例如抑制下胚轴伸长,子叶膨胀以及黄酮积累。持续的高强度辐射会导致DNA的损伤、氧化应激、脂质和蛋白质氧化,从而导致生长发育异常。为了应对紫外线胁迫,植物已进化出通过积累防晒类黄酮,包括黄酮醇、花青素和原花青素等,来限制UV-B造成的损害。

研究表明,MYB转录因子在植物对UV-B光的应答中具有重要作用。在苦荞中,MYB4R1可以通过与类黄酮、花青素生物合成通路的基因FtCHSFtFLS以及FtUFGT启动子中的L-box基序结合,调节植物体内类黄酮和花青素的积累来响应UV-B(Liu et al., 2022)。在拟南芥中,MYB4是紫外线防晒物质合成的负调节因子,它可以抑制C4H基因的转录,该基因是紫外线防晒物质合成的关键酶。类似地,MYB7也参与抑制黄酮醇的生物合成。UV-B照射会抑制植物的下胚轴伸长、根生长,并诱导子叶扩张。在这个过程中,UVR8光感受器起着重要作用。MYB73和MYB77与UVR8以依赖UV-B的方式相互作用,并调节侧根生长。此外,UVR8还在UV-B照射下与MYB13相互作用并诱导MYB13靶基因(CHS/CHI/FLS)表达以刺激类黄酮次级代谢和子叶扩展(图11)(Xu et al., 2020)。

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图11 UV-B信号促进子叶扩张并抑制侧根生长的模式图(Xu et al., 2020)。

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小远叨叨
文章至此就告一段落了!在本次的推文中小远主要是想和大家一起学习有关MYB转录因子家族在植物响应非生物胁迫中的研究成果!希望大家通过阅读本文可以对MYB转录因子有一定的了解,感兴趣的小伙伴还可以检索相关文献获得更多有关MYB转录因子的研究内容哦。大家还有什么想看的推文也欢迎继续在评论区留言哦!

References:

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