The Plant Cell | 奥地利科研团队解析AGO蛋白调控植物生殖发育的分子机理

在有性繁殖的生物体中,遗传和表观遗传突变只有发生在种系中并因此传播给下一代时,才具有进化相关性。与大多数动物相比,植物被认为缺乏早期分离的种系,这意味着植物的体细胞可以为后代提供遗传信息。
近期,The Plant Cell在线发表了来自奥地利维也纳科学院研究团队的名为“Two ARGONAUTE proteins loaded with transposon-derived small RNAs are associated with the reproductive cell lineage in Arabidopsis”的研究成果,发现了两个装载转座子衍生的小RNA的AGO蛋白,并标记了在整个发育过程中与有性生殖相关的细胞。
在植物中,茎尖分生组织(SAM)中的干细胞产生新的器官,而转座子是自我复制的遗传元素,它在干细胞中是活跃的,并伴随其遗传给下一代;转座子的活跃会破坏细胞的基因组,因此在长期的进化过程中,植物自身形成了一套防御转座子过度繁殖的机制,来保护细胞基因组免受其危害,其中就包括AGO蛋白和小RNA调控的表观遗传机制,通过转录组测序发现,AGO5和AGO9在SAM干细胞中表现出高表达丰度。
首先,利用GFP报告基因研究了AGO5和AGO9在拟南芥中各时期的空间分布,结果显示:在幼苗萌发后七天的L2层细胞中,AGO5表现出强烈的表达信号,高于AGO9(图1)。
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图1 萌发7天后拟南芥SAM中AGO5/9表达情况
而在花的发育过程中,AGO5的表达最早出现在L1层(图2)。AGO9基因定位于细胞核,最早表达出现在花诱导之后,在拟南芥开始开花时,AGO9信号从花序的分生组织转移到花分生组织中,在心皮和雄蕊之间。
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图2 拟南芥花相关细胞中AGO5/9的表达情况

以上结果表明,AGO5/9的表达持续存在于生殖细胞中(图3),并且两者具有部分冗余的功能。
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图3 AGO5/9在生殖细胞中的荧光定位
接着,作者对AGO蛋白上装载的sRNA进行了分析。首先对2个发育时期的SAM区干细胞的L2层的sRNA进行了分离和测序(图4)。结果发现,AGO5装载的sRNA由21,22和24nt的RNA组成,并且具有5’端的偏倚;AGO9装载的sRNA 主要有24nt长度的RNA组成,这表明了AGO5和AGO9在SAM发育过程中存在多样化(图5)。
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图4 AGO5/9免疫共沉淀
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图5 AGO5/9装载的小RNA的种类及分布
随后,通过将AGO蛋白携带的sRNA与总sRNA进行比较,发现两种AGOs蛋白都主要装载了来自转座子的sRNAs(图6)
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图 6 sRNA的种类数量

最后,作者研究了AGO5/9的活性对于维持强甲基化的着丝粒间TEs异染色状态是否重要。在拟南芥雄性细胞分化过程中,SAM区的甲基化是高度动态的,如CHG甲基化增加,CHH甲基化减少,这表明转座子被CMT2甲基化。同时,发现了AGO5和AGO9相关的sRNA与CMT2甲基化的TEs序列高度相关(图7),这表明了,CMT2甲基化在AGO蛋白维持植物干细胞基因组的稳定做出了贡献。
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图7 转座子数量以及甲基化途径富集
该研究深入了解了AGO5/9蛋白在整个植物发育过程中的作用,特别是在保护分生组织细胞中基因组免受转座子破坏的作用,同时也提供了分生组织中存在一组特殊生殖细胞的直接证据。
文章链接:

https://doi.org/10.1093/plcell/koad295

文章来源:植物生物技术Pbj

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