植物 SnRK1 蛋白激酶(SNF1-related kinase 1),是一种进化上保守的能量感受蛋白激酶,当能量供应有限时,可以协调转录调控网络以维持细胞的能量稳态,为植物感受能量缺乏的核心调节子。在植物中,SnRK1不仅可以对不利生长条件下的能量调节做出反应,而且还参与协调源库之间的营养分配等功能。
近日,Nature Plants期刊在线发表了题为“Mapping of the plant SnRK1 kinase signalling network reveals a key regulatory role for the class II T6P synthase-like proteins”的文章,该研究通过磷酸化蛋白质组,证实了SnRK1与代谢酶和转录调节因子的关系,同时也指出了SnRK1对细胞内转运的调控。之后,Jelle Van Leene等人绘制了SnRK1 异源三聚体的蛋白质相互作用图谱,并研究发现SnRK1与II类T6P合酶 (TPS II) 蛋白有很强的互作,并通过生化和细胞测定,证明TPS家族蛋白是SNRK1的负调节因子。
该团队研究发现蔗糖可以触发SnRK1靶标的快速去磷酸化,并通过聚类分析,研究发现cluster II中的蛋白质富含SnRK1底物(图 1)。
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此后,该团队通过亲和纯化质谱(AP-MS)和邻近标记(PL)技术构建了SnRK1蛋白相互作用组图谱(图2),并将整个数据集可视化为PPI网络(图 3)。
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研究发现SnRK1与II类T6P合酶 (TPS II) 蛋白有很强的互作后,该团队实验(图 4)验证了TPS II蛋白具有抑制SnRK1的功能。